Divisi sintesis kimia adalah salah satu divisi dibawah Laboratorium Sentral yang bertugas untuk mendukung kegiatan di Laboratorium Sentral sebagai pusat Herbal Sciences melalui aktivitas sintesis kimia senyawa-senyawa aktif yang terkandung dalam obat ataupun dalam herbal terstandar. Beberapa aktivitas sintesis yang saat ini sedang dilakukan adalah sintensis senyawa antijamur dan juga sintensis senyawa antioksidan. Beberapa fasilitas yang ada di divisi ini di antaranya adalah fasilitas-fasilitas pendukung sintesis kimia baik itu sintesis konvensional atau pun sintesis dengan mengunakan pelaratan canggih yang di automisasi.

Divisi sintesis kimia menyelenggarakan dan memfasilitasi kegiatan penelitian atau pun pengujian meliputi:

• Sintesis senyawa siklopeptida analog aureobasidin yang beraktivitas sebagai senyawa anti jamur.
• Sintesis senyawa heksapeptida yang beraktivitas sebagai senyawa antioksidan.
• Sintesis senyawa tetrapeptida yang beraktifitas antelmintik (obat cacing).
• Sintesis obat-obat kategori BPJS (top three) seperti parasetamol, amoxicillin dan amlodipin.